Los diversos hábitats de la reserva hacen de
ella un sitio ideal para el descanso y alimentación de aves migratorias de
orilla como también de mamíferos y reptiles. Entre las especies de aves
amenazadas que se protegen en la reserva están el pingüino de Humboldt y el
potoyunco peruano, que se encuentran en peligro de extinción. Otras especies en
situación vulnerable son el halcón peregrino, la chuita y cinco especies de
aves guaneras como el guanay, el pelicano, el Piquero peruano, el piquero patas
azules y el piquero enmascarado . En la zona de descanso, alimentación y
reproducción de aves residentes y migratorias se pueden observar especies como
el flamenco, el chorlo dorado, el playero solitario, entre otros. Entre los
mamíferos terrestres destacan el zorro andino y el costeño y entre los mamíferos
marinos destacan la nutria, el lobo fino y el lobo chusco, además de especies
de cetáceos migratorios y residentes como la ballena jorobada, el delfín oscuro
o chancho marino, el tonino o marsopa espinosa , el delfín nariz de botella o
bufeo , entre otros.
